Model organizma Caenorhabditis elegans’ı kullanarak, Köln Üniversitesi’ndeki araştırmacılar, bir organizmanın biyolojik yaşını doğrudan gen ifadesinden, transkriptomdan okuyan bir ‘yaşlanma saati’ geliştirdiler. Yaşlanma Araştırmalarında CECAD Mükemmeliyet Kümesi ve Moleküler Tıp Köln Merkezi’nde (CMMC) Yaşlanma ve Hastalıkta Genom Stabilitesi Enstitüsü’nün yöneticisi olan biyoinformatikçi David Meyer ve genetikçi Profesör Dr. Yaşlanma Hücresinde ‘BiT yaşı: Teorik doğruluk sınırına yakın bir transkriptom tabanlı yaşlanma saati’ makalesinde yer alan ikili transkriptomik yaşlanma saati).
Hepimiz kronolojik yaşa aşinayız – doğumdan beri yaşımız. Ancak biyolojik yaş, zaman zaman önemli ölçüde bundan farklı olabilir. Herkes farklı yaşlanır. Bilim adamları, bir organizmanın biyolojik yaşını belirlemek için yaşlanan saatleri kullanabilir. Şimdiye kadar, Horvath’ın epigenetik saati gibi yaşlanan saatler, DNA’ya bağlanan ve yaşla birlikte değişen küçük kimyasal gruplar olan metilasyon modeline dayanıyordu. Kullanma transkriptom , yeni saat dikkate hücre için proteinler olmak üzere DNA (haberci RNA) okunan gen kümesini alır.
Şimdiye kadar, transkriptom, yaşı belirtmek için çok karmaşık kabul edildi. Bazen genler özellikle büyük miktarda, bazen daha az mRNA’yı kopyalar. Bu nedenle, şimdiye kadar gen aktivitesine dayalı hassas yaşlanma saatleri geliştirmek mümkün olmamıştır. Meyer ve Schumacher’in yeni yaklaşımı, gen aktivitesindeki farklılıkları ortadan kaldırmak için matematiksel bir numara kullanıyor. İkili transkriptom yaşlanma saati, genleri “açık” veya “kapalı” olmak üzere iki gruba böler ve böylece yüksek varyasyonu en aza indirir. Bu, yaşlanmayı transkriptomdan tahmin edilebilir kılar. Şaşırtıcı bir şekilde, bu basit prosedür, teorik doğruluk sınırına yakın, biyolojik yaşın çok doğru bir şekilde tahmin edilmesine izin veriyor. En önemlisi, bu yaşlanma saati aynı zamanda yüksek yaşlarda da işe yarıyor, önceden ölçülmesi zordu çünkü o zamanlar gen aktivitesindeki varyasyon özellikle yüksek. ‘
BiT yaşı münhasıran yaklaşık 1000 farklı C. elegans transkriptomuna dayanmaktadır, bunun için ömrü kesin olarak bilinmektedir. Nematod gibi model organizmalar, yaşlanma sürecinin kontrol edilebilir bir görünümünü sağlayarak biyobelirteçlerin keşfedilmesine ve UV radyasyonu veya beslenme gibi dış etkilerin uzun ömürlülük üzerindeki etkilerinin incelenmesine izin verir.
Yeni yaşlanma saati, araştırmacıların genç yaşta nematoddaki gen varyantlarının ve çeşitli dış faktörlerin yaşlanma öncesi ve yaşlanma karşıtı etkilerini doğru bir şekilde tahmin etmelerine olanak tanıyor. Yaşlanma saati ayrıca genlerin bağışıklık tepkisinin yanı sıra nöronlardaki sinyalleşme yaşlanma süreci için önemlidir. BiT yaşı, insan yaşını hızlı ve çok yüksek bir doğrulukla tahmin etmek için de uygulanabilir. Biyolojik yaşın ölçülmesi, çevrenin, diyetin veya tedavilerin yaşlanma süreci ve yaşa bağlı hastalıkların gelişimi üzerindeki etkisini belirlemek için önemlidir. Bu saat, bu nedenle yaşlanma araştırmalarında geniş bir uygulama bulabilir. BiT yaşı tamamen gen aktivitesine dayandığından, temelde herhangi bir organizmaya uygulanabilir, ”diye açıklıyor Schumacher.
Alıntıdır bknz: Medicalxpress
